| Hinrunde | Rückrunde | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FC Bayern | - | Hamburger SV | 3:2 | Hamburger SV | - | FC Bayern | 2:1 |
| Karlsruher SC | - | FC Bayern | 2:6 | FC Bayern | - | Karlsruher SC | 1:4 |
| FC Bayern | - | KFC Uerdingen 05 | 2:0 | KFC Uerdingen 05 | - | FC Bayern | 1:6 |
| TSV 1860 München | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | TSV 1860 München | 4:2 |
| FC Bayern | - | SC Freiburg | 2:0 | SC Freiburg | - | FC Bayern | 3:1 |
| 1. FC Kaiserslautern | - | FC Bayern | 2:3 | FC Bayern | - | 1. FC Kaiserslautern | 2:0 |
| FC Bayern | - | TSV Bayer 04 Leverkusen | 1:0 | TSV Bayer 04 Leverkusen | - | FC Bayern | 1:2 |
| BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 3:1 | FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 1:0 |
| FC Bayern | - | VfL Borussia Mönchengladbach | 1:2 | VfL Borussia Mönchengladbach | - | FC Bayern | 3:1 |
| FC St. Pauli | - | FC Bayern | 0:1 | FC Bayern | - | FC St. Pauli | 1:1 |
| FC Bayern | - | VfB Stuttgart | 5:3 | VfB Stuttgart | - | FC Bayern | 0:1 |
| SG Eintracht Frankfurt | - | FC Bayern | 4:1 | FC Bayern | - | SG Eintracht Frankfurt | 1:1 |
| FC Hansa Rostock | - | FC Bayern | 0:0 | FC Bayern | - | FC Hansa Rostock | 0:1 |
| FC Bayern | - | SV Werder Bremen | 2:0 | SV Werder Bremen | - | FC Bayern | 3:2 |
| 1. FC Köln | - | FC Bayern | 0:0 | FC Bayern | - | 1. FC Köln | 3:2 |
| FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 4:0 | FC Schalke 04 | - | FC Bayern | 2:1 |
| TSV Fortuna Düsseldorf | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | TSV Fortuna Düsseldorf | 2:2 |
| 1 | BV Borussia 09 Dortmund | 34 | 19 | 11 | 4 | 76:38 | +38 | 68 |
| 2 | FC Bayern | 34 | 19 | 5 | 10 | 66:46 | +20 | 62 |
| 3 | FC Schalke 04 | 34 | 14 | 14 | 6 | 45:36 | + 9 | 56 |
| 4 | VfL Borussia Mönchengladbach | 34 | 15 | 8 | 11 | 52:51 | + 1 | 53 |
| 5 | Hamburger SV | 34 | 12 | 14 | 8 | 52:47 | + 5 | 50 |
| 6 | FC Hansa Rostock | 34 | 13 | 10 | 11 | 47:43 | + 4 | 49 |
| 7 | Karlsruher SC | 34 | 12 | 12 | 10 | 53:47 | + 6 | 48 |
| 8 | TSV 1860 München | 34 | 11 | 12 | 11 | 52:46 | + 6 | 45 |
| 9 | SV Werder Bremen | 34 | 10 | 14 | 10 | 39:42 | - 3 | 44 |
| 10 | VfB Stuttgart | 34 | 10 | 13 | 11 | 59:62 | - 3 | 43 |
| 11 | SC Freiburg | 34 | 11 | 9 | 14 | 30:41 | -11 | 42 |
| 12 | 1. FC Köln | 34 | 9 | 13 | 12 | 33:35 | - 2 | 40 |
| 13 | TSV Fortuna Düsseldorf | 34 | 8 | 16 | 10 | 40:47 | - 7 | 40 |
| 14 | TSV Bayer 04 Leverkusen | 34 | 8 | 14 | 12 | 37:38 | - 1 | 38 |
| 15 | FC St. Pauli | 34 | 9 | 11 | 14 | 43:51 | - 8 | 38 |
| 16 | 1. FC Kaiserslautern | 34 | 6 | 18 | 10 | 31:37 | - 6 | 36 |
| 17 | SG Eintracht Frankfurt | 34 | 7 | 11 | 16 | 43:68 | -25 | 32 |
| 18 | KFC Uerdingen 05 | 34 | 5 | 11 | 18 | 33:56 | -23 | 26 |
| Erste Runde | FC Bayern | - | FC Lokomotive Moskau | 0:1 |
| FC Lokomotive Moskau | - | FC Bayern | 0:5 | |
| Zweite Runde | Raith Rovers FC | - | FC Bayern | 0:2 |
| FC Bayern | - | Raith Rovers FC | 2:1 | |
| Achtelfinale | FC Bayern | - | SL Benfica Lissabon | 4:1 |
| SL Benfica Lissabon | - | FC Bayern | 1:3 | |
| Viertelfinale | FC Bayern | - | Nottingham Forest FC | 2:1 |
| Nottingham Forest FC | - | FC Bayern | 1:5 | |
| Halbfinale | FC Bayern | - | FC Barcelona | 2:2 |
| FC Barcelona | - | FC Bayern | 1:2 | |
| Finale | FC Bayern | - | FC Girondins Bordeaux | 2:0 |
| FC Girondins Bordeaux | - | FC Bayern | 1:3 | |