| Hinrunde | Rückrunde | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FC Bayern | - | Hamburger SV | 5:0 | Hamburger SV | - | FC Bayern | 1:2 |
| TSG 1899 Hoffenheim | - | FC Bayern | 1:2 | FC Bayern | - | TSG 1899 Hoffenheim | 2:0 |
| FC Bayern | - | TSV Bayer 04 Leverkusen | 3:0 | TSV Bayer 04 Leverkusen | - | FC Bayern | 0:0 |
| FC Bayern | - | FC Augsburg | 2:1 | FC Augsburg | - | FC Bayern | 1:3 |
| SV Darmstadt 98 | - | FC Bayern | 0:3 | FC Bayern | - | SV Darmstadt 98 | 3:1 |
| FC Bayern | - | VfL Wolfsburg | 5:1 | VfL Wolfsburg | - | FC Bayern | 0:2 |
| 1. FSV Mainz 05 | - | FC Bayern | 0:3 | FC Bayern | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:2 |
| FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 5:1 | BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 0:0 |
| SV Werder Bremen | - | FC Bayern | 0:1 | FC Bayern | - | SV Werder Bremen | 5:0 |
| FC Bayern | - | 1. FC Köln | 4:0 | 1. FC Köln | - | FC Bayern | 0:1 |
| SG Eintracht Frankfurt | - | FC Bayern | 0:0 | FC Bayern | - | SG Eintracht Frankfurt | 1:0 |
| FC Bayern | - | VfB Stuttgart | 4:0 | VfB Stuttgart | - | FC Bayern | 1:3 |
| FC Schalke 04 | - | FC Bayern | 1:3 | FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 3:0 |
| FC Bayern | - | Hertha BSC | 2:0 | Hertha BSC | - | FC Bayern | 0:2 |
| VfL Borussia Mönchengladbach | - | FC Bayern | 3:1 | FC Bayern | - | VfL Borussia Mönchengladbach | 1:1 |
| FC Bayern | - | FC Ingolstadt 04 | 2:0 | FC Ingolstadt 04 | - | FC Bayern | 1:2 |
| SV Hannover 96 | - | FC Bayern | 0:1 | FC Bayern | - | SV Hannover 96 | 3:1 |
| 1 | FC Bayern | 34 | 28 | 4 | 2 | 80:17 | +63 | 88 |
| 2 | BV Borussia 09 Dortmund | 34 | 24 | 6 | 4 | 82:34 | +48 | 78 |
| 3 | TSV Bayer 04 Leverkusen | 34 | 18 | 6 | 10 | 56:40 | +16 | 60 |
| 4 | VfL Borussia Mönchengladbach | 34 | 17 | 4 | 13 | 67:50 | +17 | 55 |
| 5 | FC Schalke 04 | 34 | 15 | 7 | 12 | 51:49 | + 2 | 52 |
| 6 | 1. FSV Mainz 05 | 34 | 14 | 8 | 12 | 46:42 | + 4 | 50 |
| 7 | Hertha BSC | 34 | 14 | 8 | 12 | 42:42 | ± 0 | 50 |
| 8 | VfL Wolfsburg | 34 | 12 | 9 | 13 | 47:49 | - 2 | 45 |
| 9 | 1. FC Köln | 34 | 10 | 13 | 11 | 38:42 | - 4 | 43 |
| 10 | Hamburger SV | 34 | 11 | 8 | 15 | 40:46 | - 6 | 41 |
| 11 | FC Ingolstadt 04 | 34 | 10 | 10 | 14 | 33:42 | - 9 | 40 |
| 12 | FC Augsburg | 34 | 9 | 11 | 14 | 42:52 | -10 | 38 |
| 13 | SV Werder Bremen | 34 | 10 | 8 | 16 | 50:65 | -15 | 38 |
| 14 | SV Darmstadt 98 | 34 | 9 | 11 | 14 | 38:53 | -15 | 38 |
| 15 | TSG 1899 Hoffenheim | 34 | 9 | 10 | 15 | 39:54 | -15 | 37 |
| 16 | SG Eintracht Frankfurt | 34 | 9 | 9 | 16 | 34:52 | -18 | 36 |
| 17 | VfB Stuttgart | 34 | 9 | 6 | 19 | 50:75 | -25 | 33 |
| 18 | SV Hannover 96 | 34 | 7 | 4 | 23 | 31:62 | -31 | 25 |
| Finale | VfL Wolfsburg | - | FC Bayern | 1:1, 5:4 i.E. |
| Vorrunde | FC Olympiakos Piräus | - | FC Bayern | 0:3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | GNK Dinamo Zagreb | 5:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Arsenal | - | FC Bayern | 2:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FC Arsenal | 5:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FC Olympiakos Piräus | 4:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| GNK Dinamo Zagreb | - | FC Bayern | 0:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Achtelfinale | FC Juventus Turin | - | FC Bayern | 2:2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FC Juventus Turin | 4:2 n.V. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Viertelfinale | FC Bayern | - | SL Benfica Lissabon | 1:0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| SL Benfica Lissabon | - | FC Bayern | 2:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Halbfinale | Atletico Madrid | - | FC Bayern | 1:0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | Atletico Madrid | 2:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||