| Hinrunde | Rückrunde | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FC Bayern | - | 1. FC Kaiserslautern | 0:1 | 1. FC Kaiserslautern | - | FC Bayern | 2:0 |
| VfL Borussia Mönchengladbach | - | FC Bayern | 1:1 | FC Bayern | - | VfL Borussia Mönchengladbach | 3:2 |
| FC Bayern | - | VfL Wolfsburg | 5:2 | VfL Wolfsburg | - | FC Bayern | 2:3 |
| Hamburger SV | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | Hamburger SV | 3:0 |
| FC Hansa Rostock | - | FC Bayern | 1:3 | FC Bayern | - | FC Hansa Rostock | 2:0 |
| FC Bayern | - | Hertha BSC | 3:0 | Hertha BSC | - | FC Bayern | 2:1 |
| 1. FC Köln | - | FC Bayern | 1:3 | FC Bayern | - | 1. FC Köln | 0:2 |
| FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 1:1 | FC Schalke 04 | - | FC Bayern | 1:0 |
| VfL Bochum | - | FC Bayern | 2:3 | FC Bayern | - | VfL Bochum | 0:0 |
| FC Bayern | - | VfB Stuttgart | 3:3 | VfB Stuttgart | - | FC Bayern | 0:3 |
| Karlsruher SC | - | FC Bayern | 1:1 | FC Bayern | - | Karlsruher SC | 1:1 |
| FC Bayern | - | SV Werder Bremen | 2:0 | SV Werder Bremen | - | FC Bayern | 0:3 |
| TSV 1860 München | - | FC Bayern | 2:2 | FC Bayern | - | TSV 1860 München | 3:1 |
| FC Bayern | - | DSC Arminia Bielefeld | 1:0 | DSC Arminia Bielefeld | - | FC Bayern | 4:4 |
| TSV Bayer 04 Leverkusen | - | FC Bayern | 4:2 | FC Bayern | - | TSV Bayer 04 Leverkusen | 2:1 |
| FC Bayern | - | MSV Duisburg | 3:0 | MSV Duisburg | - | FC Bayern | 0:0 |
| BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 4:0 |
| 1 | 1. FC Kaiserslautern | 34 | 19 | 11 | 4 | 63:39 | +24 | 68 |
| 2 | FC Bayern | 34 | 19 | 9 | 6 | 69:37 | +32 | 66 |
| 3 | TSV Bayer 04 Leverkusen | 34 | 14 | 13 | 7 | 66:39 | +27 | 55 |
| 4 | VfB Stuttgart | 34 | 14 | 10 | 10 | 55:49 | + 6 | 52 |
| 5 | FC Schalke 04 | 34 | 13 | 13 | 8 | 38:32 | + 6 | 52 |
| 6 | FC Hansa Rostock | 34 | 14 | 9 | 11 | 54:46 | + 8 | 51 |
| 7 | SV Werder Bremen | 34 | 14 | 8 | 12 | 43:47 | - 4 | 50 |
| 8 | MSV Duisburg | 34 | 11 | 11 | 12 | 43:44 | - 1 | 44 |
| 9 | Hamburger SV | 34 | 11 | 11 | 12 | 38:46 | - 8 | 44 |
| 10 | BV Borussia 09 Dortmund | 34 | 11 | 10 | 13 | 57:55 | + 2 | 43 |
| 11 | Hertha BSC | 34 | 12 | 7 | 15 | 41:53 | -12 | 43 |
| 12 | VfL Bochum | 34 | 11 | 8 | 15 | 41:49 | - 8 | 41 |
| 13 | TSV 1860 München | 34 | 11 | 8 | 15 | 43:54 | -11 | 41 |
| 14 | VfL Wolfsburg | 34 | 11 | 6 | 17 | 38:54 | -16 | 39 |
| 15 | VfL Borussia Mönchengladbach | 34 | 9 | 11 | 14 | 54:59 | - 5 | 38 |
| 16 | Karlsruher SC | 34 | 9 | 11 | 14 | 48:60 | -12 | 38 |
| 17 | 1. FC Köln | 34 | 10 | 6 | 18 | 49:64 | -15 | 36 |
| 18 | DSC Arminia Bielefeld | 34 | 8 | 8 | 18 | 43:56 | -13 | 32 |
| Vorrunde | FC Bayern | - | JK Besiktas Istanbul | 2:0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| IFK Göteborg | - | FC Bayern | 1:3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FC Paris St. Germain | 5:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Paris St. Germain | - | FC Bayern | 3:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| JK Besiktas Istanbul | - | FC Bayern | 0:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | IFK Göteborg | 0:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Viertelfinale | FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 0:0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 1:0 n.V. | |||||||||||||||||||||||||||||||||