| Hinrunde | Rückrunde | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SpVgg Greuther Fürth | - | FC Bayern | 0:3 | FC Bayern | - | SpVgg Greuther Fürth | 2:0 |
| FC Bayern | - | VfB Stuttgart | 6:1 | VfB Stuttgart | - | FC Bayern | 0:2 |
| FC Bayern | - | 1. FSV Mainz 05 | 3:1 | 1. FSV Mainz 05 | - | FC Bayern | 0:3 |
| FC Schalke 04 | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 4:0 |
| FC Bayern | - | VfL Wolfsburg | 3:0 | VfL Wolfsburg | - | FC Bayern | 0:2 |
| SV Werder Bremen | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | SV Werder Bremen | 6:1 |
| FC Bayern | - | TSG 1899 Hoffenheim | 2:0 | TSG 1899 Hoffenheim | - | FC Bayern | 0:1 |
| TSV Fortuna Düsseldorf | - | FC Bayern | 0:5 | FC Bayern | - | TSV Fortuna Düsseldorf | 3:2 |
| FC Bayern | - | TSV Bayer 04 Leverkusen | 1:2 | TSV Bayer 04 Leverkusen | - | FC Bayern | 1:2 |
| Hamburger SV | - | FC Bayern | 0:3 | FC Bayern | - | Hamburger SV | 9:2 |
| FC Bayern | - | SG Eintracht Frankfurt | 2:0 | SG Eintracht Frankfurt | - | FC Bayern | 0:1 |
| 1. FC Nürnberg | - | FC Bayern | 1:1 | FC Bayern | - | 1. FC Nürnberg | 4:0 |
| FC Bayern | - | SV Hannover 96 | 5:0 | SV Hannover 96 | - | FC Bayern | 1:6 |
| SC Freiburg | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | SC Freiburg | 1:0 |
| FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 1:1 | BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 1:1 |
| FC Augsburg | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | FC Augsburg | 3:0 |
| FC Bayern | - | VfL Borussia Mönchengladbach | 1:1 | VfL Borussia Mönchengladbach | - | FC Bayern | 3:4 |
| 1 | FC Bayern | 34 | 29 | 4 | 1 | 98:18 | +80 | 91 |
| 2 | BV Borussia 09 Dortmund | 34 | 19 | 9 | 6 | 81:42 | +39 | 66 |
| 3 | TSV Bayer 04 Leverkusen | 34 | 19 | 8 | 7 | 65:39 | +26 | 65 |
| 4 | FC Schalke 04 | 34 | 16 | 7 | 11 | 58:50 | + 8 | 55 |
| 5 | SC Freiburg | 34 | 14 | 9 | 11 | 45:40 | + 5 | 51 |
| 6 | SG Eintracht Frankfurt | 34 | 14 | 9 | 11 | 49:46 | + 3 | 51 |
| 7 | Hamburger SV | 34 | 14 | 6 | 14 | 42:53 | -11 | 48 |
| 8 | VfL Borussia Mönchengladbach | 34 | 12 | 11 | 11 | 45:49 | - 4 | 47 |
| 9 | SV Hannover 96 | 34 | 13 | 6 | 15 | 60:62 | - 2 | 45 |
| 10 | 1. FC Nürnberg | 34 | 11 | 11 | 12 | 39:47 | - 8 | 44 |
| 11 | VfL Wolfsburg | 34 | 10 | 13 | 11 | 47:52 | - 5 | 43 |
| 12 | VfB Stuttgart | 34 | 12 | 7 | 15 | 37:55 | -18 | 43 |
| 13 | 1. FSV Mainz 05 | 34 | 10 | 12 | 12 | 42:44 | - 2 | 42 |
| 14 | SV Werder Bremen | 34 | 8 | 10 | 16 | 50:66 | -16 | 34 |
| 15 | FC Augsburg | 34 | 8 | 9 | 17 | 33:51 | -18 | 33 |
| 16 | TSG 1899 Hoffenheim | 34 | 8 | 7 | 19 | 42:67 | -25 | 31 |
| 17 | TSV Fortuna Düsseldorf | 34 | 7 | 9 | 18 | 39:57 | -18 | 30 |
| 18 | SpVgg Greuther Fürth | 34 | 4 | 9 | 21 | 26:60 | -34 | 21 |
| Finale | FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 2:1 |
| Vorrunde | FC Bayern | - | CF Valencia | 2:1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FK BATE Baryssau | - | FC Bayern | 3:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| OSC Lille | - | FC Bayern | 0:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | OSC Lille | 6:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| CF Valencia | - | FC Bayern | 1:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FK BATE Baryssau | 4:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Achtelfinale | FC Arsenal | - | FC Bayern | 1:3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FC Arsenal | 0:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Viertelfinale | FC Bayern | - | FC Juventus Turin | 2:0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Juventus Turin | - | FC Bayern | 0:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Halbfinale | FC Bayern | - | FC Barcelona | 4:0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Barcelona | - | FC Bayern | 0:3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Finale | BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 1:2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||