| Hinrunde | Rückrunde | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FC Bayern | - | VfL Borussia Mönchengladbach | 0:1 | VfL Borussia Mönchengladbach | - | FC Bayern | 3:1 |
| VfL Wolfsburg | - | FC Bayern | 0:1 | FC Bayern | - | VfL Wolfsburg | 2:0 |
| FC Bayern | - | Hamburger SV | 5:0 | Hamburger SV | - | FC Bayern | 1:1 |
| 1. FC Kaiserslautern | - | FC Bayern | 0:3 | FC Bayern | - | 1. FC Kaiserslautern | 2:0 |
| FC Bayern | - | SC Freiburg | 7:0 | SC Freiburg | - | FC Bayern | 0:0 |
| FC Schalke 04 | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 2:0 |
| FC Bayern | - | TSV Bayer 04 Leverkusen | 3:0 | TSV Bayer 04 Leverkusen | - | FC Bayern | 2:0 |
| TSG 1899 Hoffenheim | - | FC Bayern | 0:0 | FC Bayern | - | TSG 1899 Hoffenheim | 7:1 |
| FC Bayern | - | Hertha BSC | 4:0 | Hertha BSC | - | FC Bayern | 0:6 |
| SV Hannover 96 | - | FC Bayern | 2:1 | FC Bayern | - | SV Hannover 96 | 2:1 |
| FC Bayern | - | 1. FC Nürnberg | 4:0 | 1. FC Nürnberg | - | FC Bayern | 0:1 |
| FC Augsburg | - | FC Bayern | 1:2 | FC Bayern | - | FC Augsburg | 2:1 |
| FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 0:1 | BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 1:0 |
| 1. FSV Mainz 05 | - | FC Bayern | 3:2 | FC Bayern | - | 1. FSV Mainz 05 | 0:0 |
| FC Bayern | - | SV Werder Bremen | 4:1 | SV Werder Bremen | - | FC Bayern | 1:2 |
| VfB Stuttgart | - | FC Bayern | 1:2 | FC Bayern | - | VfB Stuttgart | 2:0 |
| FC Bayern | - | 1. FC Köln | 3:0 | 1. FC Köln | - | FC Bayern | 1:4 |
| 1 | BV Borussia 09 Dortmund | 34 | 25 | 6 | 3 | 80:25 | +55 | 81 |
| 2 | FC Bayern | 34 | 23 | 4 | 7 | 77:22 | +55 | 73 |
| 3 | FC Schalke 04 | 34 | 20 | 4 | 10 | 74:44 | +30 | 64 |
| 4 | VfL Borussia Mönchengladbach | 34 | 17 | 9 | 8 | 49:24 | +25 | 60 |
| 5 | TSV Bayer 04 Leverkusen | 34 | 15 | 9 | 10 | 52:44 | + 8 | 54 |
| 6 | VfB Stuttgart | 34 | 15 | 8 | 11 | 63:46 | +17 | 53 |
| 7 | SV Hannover 96 | 34 | 12 | 12 | 10 | 41:45 | - 4 | 48 |
| 8 | VfL Wolfsburg | 34 | 13 | 5 | 16 | 47:60 | -13 | 44 |
| 9 | SV Werder Bremen | 34 | 11 | 9 | 14 | 49:58 | - 9 | 42 |
| 10 | 1. FC Nürnberg | 34 | 12 | 6 | 16 | 38:49 | -11 | 42 |
| 11 | TSG 1899 Hoffenheim | 34 | 10 | 11 | 13 | 41:47 | - 6 | 41 |
| 12 | SC Freiburg | 34 | 10 | 10 | 14 | 45:61 | -16 | 40 |
| 13 | 1. FSV Mainz 05 | 34 | 9 | 12 | 13 | 47:51 | - 4 | 39 |
| 14 | FC Augsburg | 34 | 8 | 14 | 12 | 36:49 | -13 | 38 |
| 15 | Hamburger SV | 34 | 8 | 12 | 14 | 35:57 | -22 | 36 |
| 16 | Hertha BSC | 34 | 7 | 10 | 17 | 38:64 | -26 | 31 |
| 17 | 1. FC Köln | 34 | 8 | 6 | 20 | 39:75 | -36 | 30 |
| 18 | 1. FC Kaiserslautern | 34 | 4 | 11 | 19 | 24:54 | -30 | 23 |
| Qualifikation | FC Bayern | - | FC Zürich | 2:0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Zürich | - | FC Bayern | 0:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Vorrunde | CF Villarreal | - | FC Bayern | 0:2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | Manchester City FC | 2:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| SSC Neapel | - | FC Bayern | 1:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | SSC Neapel | 3:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | CF Villarreal | 3:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Manchester City FC | - | FC Bayern | 2:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Achtelfinale | FC Basel | - | FC Bayern | 1:0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FC Basel | 7:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Viertelfinale | Olympique Marseille | - | FC Bayern | 0:2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | Olympique Marseille | 2:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Halbfinale | FC Bayern | - | Real Madrid CF | 2:1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Real Madrid CF | - | FC Bayern | 2:1 n.V., 1:3 i.E. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Finale | FC Bayern | - | FC Chelsea | 1:1 n.V., 3:4 i.E. | ||||||||||||||||||||||||||||||||