| Hinrunde | Rückrunde | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VfL Borussia Mönchengladbach | - | FC Bayern | 0:0 | FC Bayern | - | VfL Borussia Mönchengladbach | 3:0 |
| FC Bayern | - | DSC Arminia Bielefeld | 6:2 | DSC Arminia Bielefeld | - | FC Bayern | 0:0 |
| Hamburger SV | - | FC Bayern | 0:3 | FC Bayern | - | Hamburger SV | 1:1 |
| FC Bayern | - | TSV 1860 München | 3:1 | TSV 1860 München | - | FC Bayern | 0:5 |
| 1. FC Nürnberg | - | FC Bayern | 1:2 | FC Bayern | - | 1. FC Nürnberg | 2:0 |
| FC Bayern | - | FC Energie Cottbus | 3:1 | FC Energie Cottbus | - | FC Bayern | 0:2 |
| TSV Bayer 04 Leverkusen | - | FC Bayern | 2:1 | FC Bayern | - | TSV Bayer 04 Leverkusen | 3:0 |
| FC Bayern | - | VfL Bochum | 4:1 | VfL Bochum | - | FC Bayern | 1:4 |
| FC Hansa Rostock | - | FC Bayern | 0:1 | FC Bayern | - | FC Hansa Rostock | 1:0 |
| FC Bayern | - | SV Hannover 96 | 3:3 | SV Hannover 96 | - | FC Bayern | 2:2 |
| SV Werder Bremen | - | FC Bayern | 2:0 | FC Bayern | - | SV Werder Bremen | 0:1 |
| FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 2:1 | BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 1:0 |
| FC Bayern | - | VfL Wolfsburg | 1:0 | VfL Wolfsburg | - | FC Bayern | 0:2 |
| 1. FC Kaiserslautern | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:0 |
| FC Bayern | - | Hertha BSC | 2:0 | Hertha BSC | - | FC Bayern | 3:6 |
| VfB Stuttgart | - | FC Bayern | 0:3 | FC Bayern | - | VfB Stuttgart | 2:1 |
| FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 0:0 | FC Schalke 04 | - | FC Bayern | 1:0 |
| 1 | FC Bayern | 34 | 23 | 6 | 5 | 70:25 | +45 | 75 |
| 2 | VfB Stuttgart | 34 | 17 | 8 | 9 | 53:39 | +14 | 59 |
| 3 | BV Borussia 09 Dortmund | 34 | 15 | 13 | 6 | 51:27 | +24 | 58 |
| 4 | Hamburger SV | 34 | 15 | 11 | 8 | 46:36 | +10 | 56 |
| 5 | Hertha BSC | 34 | 16 | 6 | 12 | 52:43 | + 9 | 54 |
| 6 | SV Werder Bremen | 34 | 16 | 4 | 14 | 51:50 | + 1 | 52 |
| 7 | FC Schalke 04 | 34 | 12 | 13 | 9 | 46:40 | + 6 | 49 |
| 8 | VfL Wolfsburg | 34 | 13 | 7 | 14 | 39:42 | - 3 | 46 |
| 9 | VfL Bochum | 34 | 12 | 9 | 13 | 55:56 | - 1 | 45 |
| 10 | TSV 1860 München | 34 | 12 | 9 | 13 | 44:52 | - 8 | 45 |
| 11 | SV Hannover 96 | 34 | 12 | 7 | 15 | 47:57 | -10 | 43 |
| 12 | VfL Borussia Mönchengladbach | 34 | 11 | 9 | 14 | 43:45 | - 2 | 42 |
| 13 | FC Hansa Rostock | 34 | 11 | 8 | 15 | 35:41 | - 6 | 41 |
| 14 | 1. FC Kaiserslautern | 34 | 10 | 10 | 14 | 40:42 | - 2 | 40 |
| 15 | TSV Bayer 04 Leverkusen | 34 | 11 | 7 | 16 | 47:56 | - 9 | 40 |
| 16 | DSC Arminia Bielefeld | 34 | 8 | 12 | 14 | 35:46 | -11 | 36 |
| 17 | 1. FC Nürnberg | 34 | 8 | 6 | 20 | 33:60 | -27 | 30 |
| 18 | FC Energie Cottbus | 34 | 7 | 9 | 18 | 34:64 | -30 | 30 |
| Vorrunde | FC Bayern | - | Hertha BSC | 2:2, 3:4 i.E. |
| Qualifikation | FK Partizan Belgrad | - | FC Bayern | 0:3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FK Partizan Belgrad | 3:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Vorrunde | FC Bayern | - | RC Deportivo La Coruña | 2:3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC Lens | - | FC Bayern | 1:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | AC Mailand | 1:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| AC Mailand | - | FC Bayern | 2:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC Deportivo La Coruña | - | FC Bayern | 2:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | RC Lens | 3:3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||