| Hinrunde | Rückrunde | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FC Bayern | - | SG Eintracht Frankfurt | 3:1 | SG Eintracht Frankfurt | - | FC Bayern | 1:1 |
| SV Hannover 96 | - | FC Bayern | 3:3 | FC Bayern | - | SV Hannover 96 | 3:1 |
| FC Bayern | - | VfL Bochum | 2:0 | VfL Bochum | - | FC Bayern | 1:0 |
| Hamburger SV | - | FC Bayern | 0:2 | FC Bayern | - | Hamburger SV | 1:0 |
| VfL Wolfsburg | - | FC Bayern | 3:2 | FC Bayern | - | VfL Wolfsburg | 2:0 |
| FC Bayern | - | TSV Bayer 04 Leverkusen | 3:3 | TSV Bayer 04 Leverkusen | - | FC Bayern | 1:3 |
| FC Hansa Rostock | - | FC Bayern | 1:2 | FC Bayern | - | FC Hansa Rostock | 3:3 |
| FC Bayern | - | Hertha BSC | 4:1 | Hertha BSC | - | FC Bayern | 1:1 |
| VfL Borussia Mönchengladbach | - | FC Bayern | 0:0 | FC Bayern | - | VfL Borussia Mönchengladbach | 5:2 |
| FC Bayern | - | 1. FC Kaiserslautern | 4:1 | 1. FC Kaiserslautern | - | FC Bayern | 0:2 |
| FC Schalke 04 | - | FC Bayern | 2:0 | FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 2:1 |
| FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 4:1 | BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 2:0 |
| TSV 1860 München | - | FC Bayern | 0:1 | FC Bayern | - | TSV 1860 München | 1:0 |
| FC Bayern | - | 1. FC Köln | 2:2 | 1. FC Köln | - | FC Bayern | 1:2 |
| SV Werder Bremen | - | FC Bayern | 1:1 | FC Bayern | - | SV Werder Bremen | 1:3 |
| FC Bayern | - | VfB Stuttgart | 1:0 | VfB Stuttgart | - | FC Bayern | 3:1 |
| SC Freiburg | - | FC Bayern | 0:6 | FC Bayern | - | SC Freiburg | 2:0 |
| 1 | SV Werder Bremen | 34 | 22 | 8 | 4 | 79:38 | +41 | 74 |
| 2 | FC Bayern | 34 | 20 | 8 | 6 | 70:39 | +31 | 68 |
| 3 | TSV Bayer 04 Leverkusen | 34 | 19 | 8 | 7 | 73:39 | +34 | 65 |
| 4 | VfB Stuttgart | 34 | 18 | 10 | 6 | 52:24 | +28 | 64 |
| 5 | VfL Bochum | 34 | 15 | 11 | 8 | 57:39 | +18 | 56 |
| 6 | BV Borussia 09 Dortmund | 34 | 16 | 7 | 11 | 59:48 | +11 | 55 |
| 7 | FC Schalke 04 | 34 | 13 | 11 | 10 | 49:42 | + 7 | 50 |
| 8 | Hamburger SV | 34 | 14 | 7 | 13 | 47:60 | -13 | 49 |
| 9 | FC Hansa Rostock | 34 | 12 | 8 | 14 | 55:54 | + 1 | 44 |
| 10 | VfL Wolfsburg | 34 | 13 | 3 | 18 | 56:61 | - 5 | 42 |
| 11 | VfL Borussia Mönchengladbach | 34 | 10 | 9 | 15 | 40:49 | - 9 | 39 |
| 12 | Hertha BSC | 34 | 9 | 12 | 13 | 42:59 | -17 | 39 |
| 13 | SC Freiburg | 34 | 10 | 8 | 16 | 42:67 | -25 | 38 |
| 14 | SV Hannover 96 | 34 | 9 | 10 | 15 | 49:63 | -14 | 37 |
| 15 | 1. FC Kaiserslautern* | 34 | 11 | 6 | 17 | 39:62 | -23 | 36 |
| 16 | SG Eintracht Frankfurt | 34 | 9 | 5 | 20 | 36:53 | -17 | 32 |
| 17 | TSV 1860 München | 34 | 8 | 8 | 18 | 32:55 | -23 | 32 |
| 18 | 1. FC Köln | 34 | 6 | 5 | 23 | 32:57 | -25 | 23 |
| Halbfinale | FC Bayern | - | Hamburger SV | 3:3, 1:4 i.E. |
| Erste Runde | VfB Borussia Neunkirchen | - | FC Bayern | 0:5 |
| Zweite Runde | FC Bayern | - | 1. FC Nürnberg | 1:1 n.V., 7:6 i.E. |
| Achtelfinale | FC Bayern | - | Hamburger SV | 3:0 |
| Viertelfinale | TSV Alemannia Aachen | - | FC Bayern | 2:1 |
| Vorrunde | FC Bayern | - | FC Celtic Glasgow | 2:1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| RSC Anderlecht | - | FC Bayern | 1:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Olympique Lyon | - | FC Bayern | 1:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | Olympique Lyon | 1:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Celtic Glasgow | - | FC Bayern | 0:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | RSC Anderlecht | 1:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Achtelfinale | FC Bayern | - | Real Madrid CF | 1:1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Real Madrid CF | - | FC Bayern | 1:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||