| Hinrunde | Rückrunde | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 2:0 | BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 3:2 |
| VfL Bochum | - | FC Bayern | 1:2 | FC Bayern | - | VfL Bochum | 0:0 |
| FC Bayern | - | 1. FC Nürnberg | 0:0 | 1. FC Nürnberg | - | FC Bayern | 3:0 |
| DSC Arminia Bielefeld | - | FC Bayern | 2:1 | FC Bayern | - | DSC Arminia Bielefeld | 1:0 |
| FC Bayern | - | TSV Alemannia Aachen | 2:1 | TSV Alemannia Aachen | - | FC Bayern | 1:0 |
| VfL Wolfsburg | - | FC Bayern | 1:0 | FC Bayern | - | VfL Wolfsburg | 2:1 |
| FC Bayern | - | Hertha BSC | 4:2 | Hertha BSC | - | FC Bayern | 2:3 |
| SV Werder Bremen | - | FC Bayern | 3:1 | FC Bayern | - | SV Werder Bremen | 1:1 |
| FC Bayern | - | SG Eintracht Frankfurt | 2:0 | SG Eintracht Frankfurt | - | FC Bayern | 1:0 |
| FC Schalke 04 | - | FC Bayern | 2:2 | FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 2:0 |
| FC Bayern | - | SV Hannover 96 | 0:1 | SV Hannover 96 | - | FC Bayern | 1:2 |
| TSV Bayer 04 Leverkusen | - | FC Bayern | 2:3 | FC Bayern | - | TSV Bayer 04 Leverkusen | 2:1 |
| FC Bayern | - | VfB Stuttgart | 2:1 | VfB Stuttgart | - | FC Bayern | 2:0 |
| Hamburger SV | - | FC Bayern | 1:2 | FC Bayern | - | Hamburger SV | 1:2 |
| FC Bayern | - | VfL Borussia Mönchengladbach | 1:1 | VfL Borussia Mönchengladbach | - | FC Bayern | 1:1 |
| FC Bayern | - | FC Energie Cottbus | 2:1 | FC Energie Cottbus | - | FC Bayern | 0:3 |
| 1. FSV Mainz 05 | - | FC Bayern | 0:4 | FC Bayern | - | 1. FSV Mainz 05 | 5:2 |
| 1 | VfB Stuttgart | 34 | 21 | 7 | 6 | 61:37 | +24 | 70 |
| 2 | FC Schalke 04 | 34 | 21 | 5 | 8 | 53:32 | +21 | 68 |
| 3 | SV Werder Bremen | 34 | 20 | 6 | 8 | 76:40 | +36 | 66 |
| 4 | FC Bayern | 34 | 18 | 6 | 10 | 55:40 | +15 | 60 |
| 5 | TSV Bayer 04 Leverkusen | 34 | 15 | 6 | 13 | 54:49 | + 5 | 51 |
| 6 | 1. FC Nürnberg | 34 | 11 | 15 | 8 | 43:32 | +11 | 48 |
| 7 | Hamburger SV | 34 | 10 | 15 | 9 | 43:37 | + 6 | 45 |
| 8 | VfL Bochum | 34 | 13 | 6 | 15 | 49:50 | - 1 | 45 |
| 9 | BV Borussia 09 Dortmund | 34 | 12 | 8 | 14 | 41:43 | - 2 | 44 |
| 10 | Hertha BSC | 34 | 12 | 8 | 14 | 50:55 | - 5 | 44 |
| 11 | SV Hannover 96 | 34 | 12 | 8 | 14 | 41:50 | - 9 | 44 |
| 12 | DSC Arminia Bielefeld | 34 | 11 | 9 | 14 | 47:49 | - 2 | 42 |
| 13 | FC Energie Cottbus | 34 | 11 | 8 | 15 | 38:49 | -11 | 41 |
| 14 | SG Eintracht Frankfurt | 34 | 9 | 13 | 12 | 46:58 | -12 | 40 |
| 15 | VfL Wolfsburg | 34 | 8 | 13 | 13 | 37:45 | - 8 | 37 |
| 16 | 1. FSV Mainz 05 | 34 | 8 | 10 | 16 | 34:57 | -23 | 34 |
| 17 | TSV Alemannia Aachen | 34 | 9 | 7 | 18 | 46:70 | -24 | 34 |
| 18 | VfL Borussia Mönchengladbach | 34 | 6 | 8 | 20 | 23:44 | -21 | 26 |
| Halbfinale | FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 0:0, 4:1 i.E. |
| Finale | FC Bayern | - | SV Werder Bremen | 0:2 |
| Vorrunde | FC Bayern | - | FK Spartak Moskau | 4:0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Internazionale Mailand | - | FC Bayern | 0:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sporting Lissabon | - | FC Bayern | 0:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | Sporting Lissabon | 0:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FK Spartak Moskau | - | FC Bayern | 2:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FC Internazionale Mailand | 1:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Achtelfinale | Real Madrid CF | - | FC Bayern | 3:2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | Real Madrid CF | 2:1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Viertelfinale | AC Mailand | - | FC Bayern | 2:2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | AC Mailand | 0:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||