| Hinrunde | Rückrunde | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FC Bayern | - | VfL Wolfsburg | 2:1 | VfL Wolfsburg | - | FC Bayern | 1:1 |
| 1. FC Kaiserslautern | - | FC Bayern | 2:0 | FC Bayern | - | 1. FC Kaiserslautern | 5:1 |
| FC Bayern | - | SV Werder Bremen | 0:0 | SV Werder Bremen | - | FC Bayern | 1:3 |
| FC Bayern | - | 1. FC Köln | 0:0 | 1. FC Köln | - | FC Bayern | 3:2 |
| TSG 1899 Hoffenheim | - | FC Bayern | 1:2 | FC Bayern | - | TSG 1899 Hoffenheim | 4:0 |
| FC Bayern | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:2 | 1. FSV Mainz 05 | - | FC Bayern | 1:3 |
| BV Borussia 09 Dortmund | - | FC Bayern | 2:0 | FC Bayern | - | BV Borussia 09 Dortmund | 1:3 |
| FC Bayern | - | SV Hannover 96 | 3:0 | SV Hannover 96 | - | FC Bayern | 3:1 |
| Hamburger SV | - | FC Bayern | 0:0 | FC Bayern | - | Hamburger SV | 6:0 |
| FC Bayern | - | SC Freiburg | 4:2 | SC Freiburg | - | FC Bayern | 1:2 |
| VfL Borussia Mönchengladbach | - | FC Bayern | 3:3 | FC Bayern | - | VfL Borussia Mönchengladbach | 1:0 |
| FC Bayern | - | 1. FC Nürnberg | 3:0 | 1. FC Nürnberg | - | FC Bayern | 1:1 |
| TSV Bayer 04 Leverkusen | - | FC Bayern | 1:1 | FC Bayern | - | TSV Bayer 04 Leverkusen | 5:1 |
| FC Bayern | - | SG Eintracht Frankfurt | 4:1 | SG Eintracht Frankfurt | - | FC Bayern | 1:1 |
| FC Schalke 04 | - | FC Bayern | 2:0 | FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 4:1 |
| FC Bayern | - | FC St. Pauli | 3:0 | FC St. Pauli | - | FC Bayern | 1:8 |
| VfB Stuttgart | - | FC Bayern | 3:5 | FC Bayern | - | VfB Stuttgart | 2:1 |
| 1 | BV Borussia 09 Dortmund | 34 | 23 | 6 | 5 | 67:22 | +45 | 75 |
| 2 | TSV Bayer 04 Leverkusen | 34 | 20 | 8 | 6 | 64:44 | +20 | 68 |
| 3 | FC Bayern | 34 | 19 | 8 | 7 | 81:40 | +41 | 65 |
| 4 | SV Hannover 96 | 34 | 19 | 3 | 12 | 49:45 | + 4 | 60 |
| 5 | 1. FSV Mainz 05 | 34 | 18 | 4 | 12 | 52:39 | +13 | 58 |
| 6 | 1. FC Nürnberg | 34 | 13 | 8 | 13 | 47:45 | + 2 | 47 |
| 7 | 1. FC Kaiserslautern | 34 | 13 | 7 | 14 | 48:51 | - 3 | 46 |
| 8 | Hamburger SV | 34 | 12 | 9 | 13 | 46:52 | - 6 | 45 |
| 9 | SC Freiburg | 34 | 13 | 5 | 16 | 41:50 | - 9 | 44 |
| 10 | 1. FC Köln | 34 | 13 | 5 | 16 | 47:62 | -15 | 44 |
| 11 | TSG 1899 Hoffenheim | 34 | 11 | 10 | 13 | 50:50 | ± 0 | 43 |
| 12 | VfB Stuttgart | 34 | 12 | 6 | 16 | 60:59 | + 1 | 42 |
| 13 | SV Werder Bremen | 34 | 10 | 11 | 13 | 47:61 | -14 | 41 |
| 14 | FC Schalke 04 | 34 | 11 | 7 | 16 | 38:44 | - 6 | 40 |
| 15 | VfL Wolfsburg | 34 | 9 | 11 | 14 | 43:48 | - 5 | 38 |
| 16 | VfL Borussia Mönchengladbach | 34 | 10 | 6 | 18 | 48:65 | -17 | 36 |
| 17 | SG Eintracht Frankfurt | 34 | 9 | 7 | 18 | 31:49 | -18 | 34 |
| 18 | FC St. Pauli | 34 | 8 | 5 | 21 | 35:68 | -33 | 29 |
| Finale | FC Bayern | - | FC Schalke 04 | 2:0 |
| Vorrunde | FC Bayern | - | AS Rom | 2:0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Basel | - | FC Bayern | 1:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | CFR Klausenburg | 3:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| CFR Klausenburg | - | FC Bayern | 0:4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| AS Rom | - | FC Bayern | 3:2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FC Basel | 3:0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Achtelfinale | FC Internazionale Mailand | - | FC Bayern | 0:1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| FC Bayern | - | FC Internazionale Mailand | 2:3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||